本馆设有采编部、特藏部、借阅部、报刊部、少儿部、信息咨询部、计算机技术部、研究辅导部、《图书馆研究》编辑部、人事科、保卫科、办公室、读者服务中心13个部门，现有各种阅览室16个、阅览座位1149个，全年365天开放。为社会提供文献外借、书刊阅览、缩微复制、信息检索、参考咨询、业务培训等各种服务。
办公室：贯彻落实馆党委、馆长办公会的各项决策；协助馆领导做好全馆业务工作的组织、协调和督查；负责全馆业务制度和业务规范的建设与管理；做好文秘、机要档案、业务统计、对外宣传、外事交流、参观接待及书刊信件收发等工作；负责对本馆网站内容进行审核，同时负责全馆财务和后勤保障工作。
(办公电话：0796- 8442360)
人事科：贯彻落实馆长办公会的决策；负责干部管理、人员考核、职称评聘、工资管理、人才招聘、岗位培训、人事档案管理及离、退休人员工作。
(办公电话：0796- 8442360)
保卫科：定期在馆内进行安全检查，建立和健全有关治安保卫的规章制度，并监督执行；协同各部门搞好内部治安综合治理；负责馆内的防火工作，并对全馆员工进行安全、防火、防盗教育。
(办公电话：0796- 8442360)
采编部：负责全馆中外文文献的采访、分编、加工工作，建立具有地方馆藏特色的文献保障系统。承担中外文图书、电子文献的标引著录和馆藏书目数据库的建设和维护工作。接收县内出版社呈缴本及社会各界单位和个人捐赠的文献。
(办公电话：0796- 8442360)
特藏部：集中收藏古籍、地方文献、民国文献和缩微文献，提供馆内特藏文献的阅览、信息咨询及复制服务；负责古籍编目与修复、文献缩微；兼承吉安县古籍保护中心办公室的工作，负责全县古籍普查和保护的指导、协调及其人员培训等工作。
(办公电话：0796- 8442360)
借阅部：收藏中外文图书、外文报刊，同时在新馆设立社科、自科、文学和外文借阅室，在老馆设立快借室，可提供书刊阅览，文献信息开发利用，个人、集体、馆际、押金等多种形式的图书外借服务。
(办公电话：0796- 8442360)
报刊部：承担每年4000多种中文报纸、期刊的订购、编目、验收加工和典藏工作。设有中文报纸阅览室、中文期刊阅览室、中文过刊库和中文报纸库、收藏建国后中文期刊13000余种、报纸1000余种，可提供中文报刊阅览、过刊外借服务以及信息咨询服务。
(办公电话：0796- 8442360)
少儿部：集中收藏各类适合少年儿童阅读的书刊，同时设立少儿图书阅览室，可提供书刊阅览、外借服务；配合采编部进行少儿图书的采选工作；开办各种有特色的少儿专题讲座和知识培训。
(办公电话：0796- 8442360)
信息咨询部：收藏政策法规、调研报告、专利标准、文摘索引及字典词典、年鉴手册、百科全书类图书，拥有维普、万方、清华同方等网络数据库，能为读者提供信息检索、网上参考咨询与原文传递、专题报告、领导决策等服务。
(办公电话：0796- 8442360)
计算机技术部：负责全馆业务自动化系统和网络的管理与维护及数字图书馆建设的技术应用；做好全馆各部门应用软件的二次开发与维护；对全馆自动化设备进行统一管理与维护；做好全县文化信息资源共享工程省级分中心工作。
(办公电话：0796- 8442360)
研究辅导部：负责全县公共图书馆系统的业务辅导和业务培训工作；开展图书馆学、情报学及相关专业的学术研究，组织图书馆学会会员开展科学研究和其他学术活动。
(办公电话：0796- 8442360）
《图书馆研究》编辑部：负责编辑、出版、发行《图书馆研究》。
(办公电话：0796- 8442360）
读者服务中心：负责借阅证和阅览证的办理，接受读者对馆内问题的咨询；举办各种讲座、报告会、展览，并定期组织、策划、承办各类读者活动；对读者存包处进行管理，并做好联系与建立图书馆流通站和分馆的工作。
(办公电话：0796- 8442360)
